Järjestö edistää fyysistä ja henkistä hyvinvointia liikunnan ja vapaa-ajan toiminnan kautta. Lisäksi Musef ry vaalii kulttuuriperintöä ja äidinkieltä.
Vuonna 2025 Musef ry keskittyy nuorten hyvinvoinnin tukemiseen, perheiden vahvistamiseen ja somalialaistaustaisten ihmisten osallisuuteen Suomessa. Järjestö järjestää tapahtumia ja tilaisuuksia, joissa nuoret ja vanhemmat saavat tietoa, vertaistukea ja mielekästä tekemistä.